புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் (PDB) கோப்பு என்றால் என்ன? விண்டோஸ் 11ல் எப்படி திறந்து பார்ப்பது?

புரத தரவு வங்கி (PDB) கோப்பு என்பது முப்பரிமாண உயிரியல் தரவைச் சேமிக்கப் பயன்படும் ஒரு கோப்பு வடிவமாகும். PDB கோப்புகள் பொதுவாக புரதங்கள், நியூக்ளிக் அமிலங்கள் மற்றும் பிற உயிர் மூலக்கூறுகள் பற்றிய தரவுகளைச் சேமிக்கப் பயன்படுகின்றன. PyMOL மற்றும் VMD போன்ற மென்பொருள்கள் உட்பட பல்வேறு வழிகளில் PDB கோப்புகளைப் பார்க்கலாம். விண்டோஸ் 11 இல், கோப்பு எக்ஸ்ப்ளோரருக்குச் சென்று, காட்சி தாவலைக் கிளிக் செய்து, மறைக்கப்பட்ட கோப்புகள் மற்றும் கோப்புறைகளைக் காண்பிப்பதற்கான விருப்பத்தைத் தேர்ந்தெடுப்பதன் மூலம் நீங்கள் ஒரு PDB கோப்பைத் திறக்கலாம். நீங்கள் இதைச் செய்தவுடன், நீங்கள் பார்க்க விரும்பும் PDB கோப்பைக் கண்டறிய முடியும். உயிர் மூலக்கூறுகளுடன் பணிபுரியும் விஞ்ஞானிகளுக்கு PDB கோப்புகள் ஒரு முக்கியமான கருவியாகும், ஏனெனில் அவை முப்பரிமாணத்தில் தரவை காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் அனுமதிக்கின்றன. PDB கோப்புகளைத் திறப்பது மற்றும் பார்ப்பது எப்படி என்பதைப் புரிந்துகொள்வது, உயிர் தகவலியல் அல்லது கணக்கீட்டு உயிரியல் துறையில் பணிபுரியும் எவருக்கும் ஒரு முக்கியமான திறமையாகும்.

புரத தரவு வங்கி (PDB) கோப்புகள் மூலக்கூறு கட்டமைப்புகளை சேமிக்கும் முப்பரிமாண மூலக்கூறு கோப்புகள். இப்போது, ​​​​அத்தகைய கோப்புகளை கணினியில் எவ்வாறு திறப்பது என்று நீங்கள் யோசிக்கிறீர்கள் என்றால், இந்த இடுகை உங்களுக்கு ஆர்வமாக இருக்கும். PDB கோப்புகள் மற்றும் Windows 11/10 இல் அத்தகைய கோப்புகளை எவ்வாறு பார்ப்பது என்பது பற்றி இங்கு விரிவாக விவாதிப்போம். எனவே, மேலும் கவலைப்படாமல், அதைப் பார்ப்போம்!

புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் (PDB) கோப்பு என்றால் என்ன?

புரத தரவு வங்கி (PDB) என்பது புரதங்கள், நியூக்ளிக் அமிலங்கள் மற்றும் பிற பெரிய மூலக்கூறுகளுக்கான 3D கட்டமைப்பு தரவுகளின் தரவுத்தளமாகும். இருந்து கோப்பு ஜிடிபி கோப்பு நீட்டிப்பு என்பது அடிப்படையில் ஒரு 3D உயிரியல் மூலக்கூறின் கட்டமைப்பு தொடர்பான தரவுகளைக் கொண்ட ஒரு கோப்பாகும். தரவு அணு ஒருங்கிணைப்புகள், அணு கட்டமைப்புகள், அணு இணைப்பு, புரத அமைப்பு, நியூக்ளிக் அமில அமைப்பு மற்றும் பலவற்றை உள்ளடக்கியது. இது சோதனை மெட்டாடேட்டாவையும் கொண்டுள்ளது.

இந்த கோப்பு வடிவம் பயோ-இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸில் புரோட்டீன் ஆயங்களை பரிமாறிக்கொள்ள பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது. இது ஒரு புரதத்தின் கட்டமைப்பை விவரிக்கும் ஆயிரக்கணக்கான வரிகளைக் கொண்டுள்ளது. இப்போது, ​​நீங்கள் விண்டோஸ் கணினியில் PDB கோப்புகளைப் படிக்க அல்லது பார்க்க விரும்பினால், அதற்கான சொந்த பயன்பாடு இல்லாததால், நீங்கள் ஒரு பிரத்யேக மூன்றாம் தரப்பு கருவியைப் பயன்படுத்த வேண்டும். இந்த இடுகையில், விண்டோஸ் 11/10 இல் PDB கோப்பைப் பார்ப்பதற்கான பல்வேறு வழிகளைப் பற்றி விவாதிப்போம்.

விண்டோஸ் 11 இல் புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் (பிடிபி) கோப்பைப் பார்ப்பது எப்படி?

விண்டோஸ் 11/10 இல் புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் (PDB) கோப்பைப் பார்க்க இரண்டு வழிகள் உள்ளன, அதாவது:

1. PDB கோப்புகளைப் பார்க்க இலவச மென்பொருளைப் பயன்படுத்தவும்.
2. PDB கோப்புகளைப் படிக்க இலவச ஆன்லைன் கருவியை முயற்சிக்கவும்.

1] PDB கோப்புகளைப் பார்க்க இலவச மென்பொருளைப் பயன்படுத்தவும்.

PDB கோப்புகளைத் திறந்து பார்க்க உங்களை அனுமதிக்கும் மூன்றாம் தரப்பு விண்டோஸ் மென்பொருளைப் பயன்படுத்தலாம். விண்டோஸுக்கு பல இலவச டெஸ்க்டாப் பயன்பாடுகள் உள்ளன, அவற்றை நீங்கள் முயற்சி செய்யலாம். நீங்கள் பயன்படுத்தக்கூடிய சில நல்லவை இங்கே:

• IQmol
• சுவிஸ்-PdbViewer
• குமோல்
• ஒரு மூலக்கூறு
• ராஸ்மோல்

A] IKmol

IQmol என்பது விண்டோஸ் 11/10க்கான இலவச மற்றும் திறந்த மூல மூலக்கூறு எடிட்டர் மற்றும் காட்சிப்படுத்தல் மென்பொருளாகும். இதைப் பயன்படுத்தி, நீங்கள் PDB மற்றும் MOL, SMI, CUBE, XYZ போன்ற பல்வேறு 3D மூலக்கூறு கோப்புகளைப் பார்க்கலாம். இந்த மென்பொருளில், அனைத்து முக்கியமான மூலக்கூறு காட்சிப்படுத்தல் கருவிகளையும் நீங்கள் காணலாம். இந்த கருவிகள் அடிப்படை முதல் மேம்பட்டவை வரை இருக்கும். PDB கோப்பைப் பார்ப்பதுடன், மூலக்கூறு கட்டமைப்பையும் நீங்கள் திருத்தலாம்.

ஒரே நேரத்தில் பல PDB கோப்புகளைத் திறக்கவும், அனைத்தையும் ஒரே நேரத்தில் பார்க்கவும் இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. மாடல் வியூ பேனலில், ஒன்று அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட PDB கோப்புகளின் ரெண்டரிங்கை இயக்கலாம் அல்லது முடக்கலாம்.

IQmol இன் முக்கிய பண்புகள்:

நீங்கள் பார்க்கக்கூடிய இந்த இலவச மற்றும் திறந்த மூல PDB கோப்பு வியூவரின் அம்சங்கள்:

• ஜூம் இன்/ஜூம் அவுட் (மவுஸ் வீலுடன்), பான், சுழற்றுதல், முழுத் திரை, ரீசெட் வியூ, ஷோ அச்சுகள் போன்ற அனைத்து நிலையான கோப்பு உலாவல் கருவிகளையும் நீங்கள் காணலாம்.
• ஷேடர், சுற்றுப்புற ஒளி, பரவல், மூடுபனி வலிமை, சிறப்பம்சங்கள், இரைச்சல் தீவிரம், POV-ரே அளவுருக்கள் போன்ற அளவுருக்களைத் திருத்துவதன் மூலம் மாதிரியின் தோற்றத்தைத் தனிப்பயனாக்க இது உங்களை அனுமதிக்கிறது.
• அணு நிறை, பகுதி சார்ஜ், என்எம்ஆர், சுழல் அடர்த்தி போன்ற அணு லேபிள்களையும் நீங்கள் சேர்க்கலாம்.
• இதன் மூலம் கேமரா அமைப்புகளை உங்கள் விருப்பப்படி தனிப்பயனாக்க முடியும். கேமரா ப்ரொஜெக்ஷன், பொசிஷன் போன்றவற்றை நீங்கள் சரிசெய்யலாம்.
• ஒரு வசதியான வேண்டும் தானியங்கி சுழற்சி மூலக்கூறு மாதிரியை தானாக சுழற்ற உங்களை அனுமதிக்கும் செயல்பாடு.
• PNG, PPM, BMP, JPG, PS, EPS போன்ற பட வடிவத்தில் தற்போதைய புரதக் கட்டமைப்புப் பிரதிநிதித்துவத்தை நீங்கள் சேமிக்கலாம்.
• 'Save As' அம்சத்தைப் பயன்படுத்தி PDBயை மற்ற மூலக்கூறு கோப்புகளாக மாற்றவும் இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. ஆதரிக்கப்படும் வெளியீட்டு வடிவங்கள்: XYZ, MOL, MOL2, CML போன்றவை.
• நீங்களும் பயன்படுத்தலாம் கணக்கீடு கணக்கிடுவதற்கான செயல்பாடுகள் மூலக்கூறு கட்டமைப்பு ஆற்றல், படைகள், PES ஸ்கேன், நிலைமாற்ற நிலை, இரசாயன மாற்றங்கள், வடிவியல், சிதைவு ஆற்றல், BSSE திருத்தம், மற்றும் பல.

செயல்பாடுகளைப் பார்ப்பதோடு கூடுதலாக, மூலக்கூறு கட்டுமான செயல்பாடுகளின் தொகுப்பைக் கொண்ட சிறப்பு பில்ட் மெனுவைப் பெறுவீர்கள். இந்த அம்சங்களில் புதிய அணுக்களைச் சேர்ப்பது, புதிய மூலக்கூறுகளைச் செருகுவது, கட்டமைப்பைக் குறைப்பது, ஐசோடோப்புகளை அமைத்தல் மற்றும் பலவும் அடங்கும்.

இது ஒரு நல்ல மூலக்கூறு மாடலிங் மென்பொருளாகும், இதன் மூலம் உங்கள் கணினியில் புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் கோப்புகளை காட்சிப்படுத்தலாம். நீங்கள் விரும்பினால், பதிவிறக்கவும் இங்கிருந்து .

பார்க்க: Chem4Word என்பது Microsoft Word க்கான வேதியியல் சேர்க்கை ஆகும். .

B] சுவிஸ்-PdbViewer

Swiss-PdbViewer என்பது Windows 11/10க்கான சிறப்பு இலவச PDB கோப்பு பார்வையாளர் ஆகும். ஒரே நேரத்தில் பல புரத கட்டமைப்புகளை காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. பிடிபி கோப்பில் உள்ள புரத அமைப்பு, டிஎன்ஏ அமைப்பு போன்றவற்றை நீங்கள் பகுப்பாய்வு செய்யலாம். PDB கோப்பைத் தவிர, MOL மற்றும் MMCIF கோப்புகளைத் திறந்து பார்க்கவும் இது உங்களை அனுமதிக்கிறது.

நீங்கள் ஒரு PDB கோப்பைத் திறக்கும்போது, ​​கட்டுப்பாட்டுப் பலக சாளரத்துடன் ஒரு 3D காட்சி இடைமுகத்தில் காட்டப்படும். கட்டுப்பாட்டு பலகத்தில் பொதுவான தகவல், பட்டியல் மற்றும் கோப்பு தலைப்பு உள்ளது. நீங்கள் எளிதாக கட்டமைப்பை நகர்த்தலாம், அதை சுழற்றலாம், பெரிதாக்கலாம்/வெளியேற்றலாம்.

உங்கள் விருப்பங்களுக்கு ஏற்ப புள்ளி மேற்பரப்பு, அடிப்படை, ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள், விசை திசையன்கள் மற்றும் பலவற்றைக் காட்ட அல்லது மறைக்க இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. கட்டமைப்பை சிறப்பாக பகுப்பாய்வு செய்ய வெவ்வேறு வண்ணத் திட்டங்களுடன் வெவ்வேறு பகுதிகளை நீங்கள் முன்னிலைப்படுத்தலாம். கூடுதலாக, ரெண்டர் இன் சாலிட் 3D, ரெண்டர் பிஓவி, டிஸ்ப்ளே லேபிள்கள் மற்றும் பல போன்ற காட்சி அம்சங்களை நீங்கள் பயன்படுத்தலாம்.

காட்சிப்படுத்தல் கருவிகளுக்கு கூடுதலாக, நீங்கள் நிறைய மூலக்கூறு மாடலிங் அம்சங்களையும் பெறுவீர்கள். கூடுதலாக, இது ஆற்றல் கணக்கீடு, எச்-பாண்ட் கணக்கீடு, டொமைன் பகுப்பாய்வு, டொமைன் கண்டறிதல், 3D மையக்கரு உருவாக்கம், படிக சமச்சீர் கட்டிடம் மற்றும் பிற கருவிகளையும் கொண்டுள்ளது.

நீங்கள் அதை பதிவிறக்கம் செய்யலாம் அதிகாரப்பூர்வ தளம் .

படி: விண்டோஸ் 11/10க்கான சிறந்த இலவச ஆற்றல் பகுப்பாய்வு மென்பொருள்.

C] QMol

குமோல் Windows 11/10க்கான மற்றொரு இலவச PDB பார்வையாளர். இது ஒரு மேக்ரோமாலிகுலர் அமைப்பு காட்சிப்படுத்தல் கருவியாகும், இதன் மூலம் நீங்கள் PDB கோப்புகளைப் பார்க்கலாம். DX, MAP, MTZ, CNS போன்றவை நீங்கள் திறந்து பார்க்கக்கூடிய பிற கோப்புகள்.

இது முன்னோக்கு மற்றும் ஆர்த்தோகிராஃபிக் காட்சிகளுக்கு இடையில் மாறவும், மாதிரியை சுழற்றவும், பெரிதாக்க / வெளியேறவும் உங்களை அனுமதிக்கிறது. நீங்கள் POV-Ray மற்றும் அதன் அனிமேஷன் ரெண்டரிங் முறைகளைப் பயன்படுத்தி மாதிரியை வழங்கலாம். ரெண்டர் செய்யப்பட்ட கட்டமைப்பை PNG வடிவத்தில் சேமிக்க முடியும். மாதிரியில் தூரம், கோணம் மற்றும் திருப்பத்தை அளவிட உங்களை அனுமதிக்கும் அளவீட்டு கருவியும் உள்ளது.

புரத கட்டமைப்பை மேலும் பகுப்பாய்வு செய்ய சில கூடுதல் கருவிகளையும் நீங்கள் காணலாம். இந்த கருவிகள் அடங்கும் மூலக்கூறு சூப்பர்போசிஷன், மோல் மேற்பரப்பு கட்டர், மோல் மேற்பரப்பு உருவாக்கம், மோல் பாண்ட் எடிட்டர், தொடர்பு பகுப்பாய்வு, மோல் மார்ப் அனிமேஷன், மற்றும் பல.

PDB கோப்புகளில் இருக்கும் புரத அமைப்பைக் காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் இது ஒரு நல்ல மென்பொருள்.

பார்க்க: .LIT விருப்பம் # Windows இல் LIT ஐ EPUB அல்லது MOBI ஆக மாற்றுவது எப்படி?

தூக்க ஜன்னல்கள் 10 க்குப் பிறகு நீலத் திரை

D] மூலக்கூறுகள்

இந்தப் பட்டியலில் உள்ள அடுத்த PDB வியூவர் மென்பொருள் மோல்கெல் ஆகும். இது பழைய ஆனால் சக்திவாய்ந்த மூலக்கூறு காட்சிப்படுத்தல் மென்பொருளாகும், இது PDB கோப்புகளைத் திறக்கவும் பார்க்கவும் உங்களை அனுமதிக்கிறது. புரத கட்டமைப்புகளை பகுப்பாய்வு செய்ய உங்களை அனுமதிக்கும் பல மூலக்கூறு காட்சிப்படுத்தல் மற்றும் பகுப்பாய்வு கருவிகளை நீங்கள் காணலாம்.

மூலக்கூறுகள், அணுக்கள், பிணைப்புகள், எச்சங்கள் போன்றவற்றின் காட்சியைத் தனிப்பயனாக்க இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. பந்து & குச்சி, CPK, அரைக்கோளம், சோஸ்பியர், முழுக் கோளம், உருளை, சோசிலிண்டர், செமிசிலிண்டர், போன்ற ஒவ்வொன்றிற்கும் வெவ்வேறு காட்சி வகைகளைத் தேர்வு செய்யலாம். வயர், ஸ்டிக், லீனியர் டேப் போன்றவை. கூடுதலாக, நீங்கள் 3D காட்சியின் பண்புகளை சரிசெய்யலாம், எல்லைப் பெட்டிகளைக் காட்டலாம்/மறைக்கலாம், ஷேடர்களைப் பயன்படுத்தலாம். கட்டமைப்பு மற்றும் கரைப்பான் கிடைக்கக்கூடிய மேற்பரப்பை கட்டமைப்பில் சேர்ப்பது.

நீங்கள் கண்டுபிடிக்க முடியும் இயங்குபடம் மூலக்கூறின் கட்டமைப்பின் அனிமேஷனை இயக்குவதற்கான ஒரு செயல்பாடு. பொருத்தமான கருவிகளுடன் கூடிய சிறப்பு 'பகுப்பாய்வு' மெனுவையும் கொண்டுள்ளது. பகுப்பாய்வுக் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி, கட்டத் தரவு, சுழற்சி அடர்த்தி, மூலக்கூறு மின்னியல் திறன், உமிழ்வு ஸ்பெக்ட்ரம், தூரம், கோணம் மற்றும் பலவற்றை ஒரு கட்டமைப்பிற்கு நீங்கள் தீர்மானிக்கலாம்.

PDB கோப்புகளை பல்வேறு கோப்பு வடிவங்களுக்கு மாற்றவும் இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. இந்த வடிவங்களில் PDF, PS, EPS மற்றும் படம் ஆகியவை அடங்கும். நீங்கள் விரும்பினால் அதைப் பெறலாம் இங்கே .

படி: முழுமையான உடற்கூறியல் பயன்பாடு விண்டோஸிற்கான தகுதியான பதிவிறக்கமாகும். .

இ] ரஸ்மோல்

Windows 11/10 இல் PDB கோப்புகளைப் பார்க்க நீங்கள் RasMol ஐப் பயன்படுத்தலாம். இது இலவச மற்றும் திறந்த மூல மென்பொருளாகும், இது மூலக்கூறு கட்டமைப்புகளை காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் உங்களை அனுமதிக்கிறது. இது MOL, XYZ, CIF, MOPAC போன்ற பிற கோப்புகளைத் திறந்து பார்ப்பதை ஆதரிக்கிறது.

கட்டமைப்பை ஒரு பிரேம், வார்ப், தண்டுகள், ரிப்பன்கள், இழைகள் போன்றவற்றைப் பார்க்க இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. வெவ்வேறு வண்ணங்களுடன் கட்டமைப்பின் வெவ்வேறு பகுதிகளையும் நீங்கள் முன்னிலைப்படுத்தலாம். உங்கள் விருப்பங்களுக்கு ஏற்ப ஹைட்ரஜன் அணுக்கள், ஹீட்டோரோட்டாம்கள், நிழல்கள், லேபிள்கள் போன்றவற்றைக் காட்ட அல்லது மறைக்க இது உங்களை அனுமதிக்கிறது. ஒரு கட்டமைப்பில் உள்ள தூரம், முறுக்கு, கோணம் மற்றும் பிற மதிப்புகளையும் நீங்கள் அளவிடலாம்.

இந்த மென்பொருள் கிடைக்கிறது இங்கே .

பார்க்க: Windows க்கான சிறந்த இலவச 3D மனித உடற்கூறியல் மென்பொருள்.

2] PDB கோப்புகளைப் படிக்க இலவச ஆன்லைன் கருவியை முயற்சிக்கவும்.

PDB கோப்புகளைத் திறக்கவும் பார்க்கவும் இலவச ஆன்லைன் கருவியையும் பயன்படுத்தலாம். நீங்கள் செய்ய வேண்டியது, இணைய உலாவியில் வலைத்தளத்தைத் திறந்து, அதைப் பார்க்க PDB கோப்பைப் பதிவிறக்கவும். நீங்கள் முயற்சி செய்யக்கூடிய சில நல்ல இலவச ஆன்லைன் PDB பார்வையாளர்கள் இங்கே:

• RCSB PDB
• மோல்சாஃப்ட்

A] RCSB PDB

தனிப்பட்ட உலாவலில் ஃபயர்பாக்ஸ் துணை நிரல்களை இயக்குகிறது

புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் கோப்புகளைக் காட்சிப்படுத்த RCSB PDB எனப்படும் இந்த இலவச ஆன்லைன் கருவியைப் பயன்படுத்தலாம். இது ஒரு PDB கோப்பை இறக்குமதி செய்து அதன் மூலக்கூறு கட்டமைப்பைக் காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் உங்களை அனுமதிக்கிறது.

பெரிதாக்கு, சுழற்றுதல், மேம்பட்ட போர்ட் காட்சி நிலைமாற்றம், கேமரா மீட்டமைப்பு, தேர்வு முறை நிலைமாற்றம் போன்ற சில அடிப்படை காட்சிப்படுத்தல் அம்சங்களை நீங்கள் காணலாம். இது கேமரா பயன்முறை (முன்னோக்கு அல்லது ஆர்த்தோகிராஃபிக்), பின்னணி வண்ணம் போன்ற சில அமைப்புகள் அல்லது கட்டுப்பாட்டு விருப்பங்களைச் சரிசெய்ய உங்களை அனுமதிக்கிறது. / ஆஃப். அடைப்பை முடக்கு, மூடுபனி, கிளிப்பிங், இருப்பிடம் போன்றவற்றை இயக்கு/முடக்கு.

அது வருகிறது உயிரூட்டு செயல்பாடு. இதைப் பயன்படுத்தி, நீங்கள் தானாகவே புரத அமைப்பை சுழற்றலாம். இதன் மூலம், நீங்கள் சுழற்சி வேகம் மற்றும் கோணத்தை சரிசெய்யலாம். நீங்கள் ஒரு அர்ப்பணிப்பையும் பெறுவீர்கள் அளவீடு அதில் உள்ள கருவி. இந்தக் கருவியைப் பயன்படுத்தி, தூரம், நோக்குநிலை, கோணம் மற்றும் பல போன்ற பல மதிப்புகளைக் கண்டறியலாம்.

இந்த அம்சங்களுடன் கூடுதலாக, பல எளிய கருவிகள் உள்ளன: கட்டமைப்பு மையக்கருத் தேடல், கூறுகளைச் சேர்த்தல், அனிமேஷன் ஏற்றுமதி, வடிவியல் ஏற்றுமதி (STL, OBJ, முதலியன) மற்றும் மாதிரி ஏற்றுமதி.

மொத்தத்தில், இது ஒரு சிறந்த காட்சிப்படுத்தல் கருவிகளைக் கொண்ட ஒரு சிறந்த இலவச ஆன்லைன் PDB பார்வையாளர். நீங்கள் முயற்சி செய்யலாம் இங்கே .

B] மோல்சாஃப்ட்

Molsoft என்பது PDB கட்டமைப்புகளைக் காட்சிப்படுத்தப் பயன்படும் மற்றொரு ஆன்லைன் கருவியாகும். இது அடிப்படை அம்சங்களுடன் கூடிய எளிய PDB கோப்பு பார்வையாளர். முதலில், அதைத் திறக்கவும் இணையதளம் மற்றும் மூன்று வழி மெனு விருப்பத்தை கிளிக் செய்யவும். அதன் பிறகு, உள்நாட்டில் சேமிக்கப்பட்ட PDB கோப்பை இறக்குமதி செய்ய 'திற' விருப்பத்தைத் தேர்ந்தெடுக்கவும் அல்லது உங்கள் Google இயக்ககத்திலிருந்து கோப்பைப் பதிவேற்றவும். நீங்கள் ஒரு கோப்பைத் தேர்ந்தெடுக்கும்போது, ​​அது பார்வையாளரில் உள்ள மூலக்கூறு அமைப்பைக் காண்பிக்கும்.

கட்டமைப்பைக் காட்சிப்படுத்த நீங்கள் வெவ்வேறு பார்வை முறைகளைப் பயன்படுத்தலாம். இந்த காட்சிகளில் வயர்ஃப்ரேம், கிரியேட்டின் பாஸ்போகினேஸ் (CPK), பந்து மற்றும் கம்பி, ரிப்பன் மற்றும் பல உள்ளன. உங்கள் தேவைகளுக்கு ஏற்ப இந்தக் காட்சி முறைகளுக்கு இடையே எளிதாக மாறலாம். கூடுதலாக, அணு லேபிள்கள், எச்ச லேபிள்கள், ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள் மற்றும் தளங்களை இயக்க அல்லது முடக்க உங்களை அனுமதிக்கிறது.

இது அளவீட்டு கருவிகளையும் வழங்குகிறது. மாதிரியில் நீங்கள் தூரம், தட்டையான கோணம் மற்றும் திருப்பக் கோணத்தை அளவிடலாம். கூடுதலாக, செயல்பாட்டின் அடிப்படையில் எளிமையான வண்ணம் கிடைக்கிறது, இது அணு வகை, சங்கிலி, சீரமைப்பு, இரண்டாம் நிலை அமைப்பு போன்றவற்றின் மூலம் கட்டமைப்பை வண்ணமயமாக்க அனுமதிக்கிறது.

இது நீங்கள் இலவசமாக முயற்சி செய்யக்கூடிய மற்றொரு நல்ல ஆன்லைன் PDB கோப்பு பார்வையாளர்.

புரோட்டீன் டேட்டா வங்கியிலிருந்து PDB கோப்பைப் பதிவிறக்குவது எப்படி?

புரோட்டீன் டேட்டா பேங்கிலிருந்து பிடிபி கோப்பைப் பதிவிறக்க, புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் இணையதளத்திற்குச் சென்று, புரதம் அல்லது மனித ஹீமோகுளோபின், சிட்டினேஸ் போன்ற பெரிய மூலக்கூறுகளின் பெயரை உள்ளிட்டு தேடலாம். பின்னர் தேடல் முடிவுகளிலிருந்து கோப்பைத் தேர்ந்தெடுக்கவும். PDB கோப்பைப் பதிவிறக்க பதிவிறக்க விருப்பத்தைப் பயன்படுத்தவும். அவ்வளவு எளிமையானது.

PDB கட்டமைப்புகளை எவ்வாறு பார்ப்பது?

பிரத்யேக ஆன்லைன் கருவி அல்லது மென்பொருள் பயன்பாட்டைப் பயன்படுத்தி PDBயின் மூலக்கூறு கட்டமைப்புகளைப் பார்க்கலாம். உங்கள் கணினியில் PDB கட்டமைப்புகளைக் காட்சிப்படுத்தவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் IQmol, Swiss-PdbViewer மற்றும் CueMol போன்ற இலவச மென்பொருட்களை நீங்கள் முயற்சி செய்யலாம். நீங்கள் ஆன்லைன் கருவியைப் பயன்படுத்த விரும்பினால், பல விருப்பங்கள் உள்ளன. எடுத்துக்காட்டாக, RCSB PDB மற்றும் Molsoft போன்ற இணைய சேவைகளை முயற்சிக்கவும். இவை மேம்பட்ட மூலக்கூறு காட்சிப்படுத்தல் மற்றும் பகுப்பாய்வு கருவிகளை வழங்கும் இலவச ஆன்லைன் PDB கோப்பு பார்வையாளர்கள்.

PDB கோப்பை PDF ஆக மாற்றுவது எப்படி?

PDB கோப்பை PDF ஆக மாற்ற, Molekel எனப்படும் இந்த இலவச டெஸ்க்டாப் பயன்பாட்டைப் பயன்படுத்தலாம். இது PDB கோப்பை PDF வடிவத்திற்கு மாற்ற அனுமதிக்கும் ஒரு சிறப்பு 'PDF இல் சேமி' விருப்பத்தை வழங்குகிறது. நீங்கள் PDB கோப்பைத் திறந்து, PDB ஐ PDF ஆக மாற்ற 'File' > 'Save to PDF' என்பதைக் கிளிக் செய்யலாம். இந்த மென்பொருளை இந்த இடுகையில் விரிவாகப் பேசியுள்ளோம், அதை மேலே பார்க்கவும்.

அவ்வளவுதான்.

இப்போது படியுங்கள்: விண்டோஸிற்கான சிறந்த இலவச மூலக்கூறு மாடலிங் மென்பொருள்.